L’attuale edificio del museo, vincolato ai sensi dell’art.4 della L.1089/39, si trova all’interno del centro storico di Grosseto ed è composto da una parte ottocentesca, tra via Corsini e via dell’Unione, e una novecentesca, tra via Corsini e piazza Pacciardi (ex piazza della Palma). La struttura possiede una corte interna con giardino alberato.
Il fabbricato appare già in una planimetria del 1823; in un documento del 1860 risulta destinato a “casa”. Nel catasto del 1917 la particella risulta frazionata in due parti e il giardino diviene di pertinenza di una delle due, la 138.
Questi mutamenti sono da attribuire al cambiamento di destinazione dell’edificio che, da abitazione civile, passò ad ospitare il primo asilo laico di Grosseto, intitolato al Re Vittorio Emanuele. In una delle tre lapidi oggi visibili nell’androne di ingresso posteriore si legge infatti la dedica e la data di inaugurazione dell’asilo: 9 gennaio 1879.